細菌検査は食中毒や膀胱炎、咽頭炎、肺炎など様々な感染症の原因となる微生物を調べる検査です。微生物とは、肉眼では見えず顕微鏡で拡大することによって見えるとても小さな生物で、その中には細菌やカビ、ウイルスが含まれ、血液や尿、便、痰などからそれらを見つけ出します。検査材料には髪の毛から足の爪、体の表面や内部とありとあらゆる検体が対象となります。

原因である菌が判明すれば、その菌にどのお薬が効くかなどを調べる薬剤感受性試験という検査も細菌検査の仕事となります。